Inleiding R
Voorwoord
1
Update/upgrade R en Rstudio
2
GGplot
2.1
Scatterplot
2.1.1
Scatterplot met regressielijn
2.1.2
1:1-lijn
2.1.3
Limieten assen aanpassen
2.1.4
Data in groepen verdelen
2.1.5
Handmatig kleur per groep bepalen
2.1.6
Per groep symbool toekennen
2.1.7
Data verdelen in meerdere grafieken
2.2
Boxplots en aanverwanten
2.2.1
Boxplots
2.2.2
Violinplots
2.2.3
Scatterplot met groepen
2.3
Staafdiagrammen
2.4
Histogrammen en densityplots
2.4.1
Histogram
2.4.2
Densityplot
3
T-toetsen
3.1
Eensteekproef t-toets
3.2
Onafhankelijke t-toets
3.3
Gepaarde t-toets
4
General linear model
4.1
Lineaire regressie
4.2
One-way ANOVA
4.2.1
Posthoc-toets
4.3
Two-way ANOVA
4.3.1
Posthoc
4.4
Random variabele(n)
5
Verdelingsvrije methoden
5.1
Spearman correlatie
5.2
Wilcoxon-toets
5.3
Kruskal-Wallis-toets
5.4
Friedman
6
Nonlineaire modellen
7
Generalized Linear Models
7.1
Binomiale data (logistische regressie)
7.2
Posthoc bij groepen met alleen nullen of enen
7.3
GGplot en logistische regressie
7.4
Poisson regressie
7.4.1
Generalized Mixed Effects Models
8
Dataformats
8.1
csv
8.1.1
layout
8.1.2
Functies om csv te lezen
8.1.3
Nog meer variatie mogelijk
8.2
JSON
8.2.1
Inlezen
8.2.2
Unnesten
8.3
netCDF
HAS University of Applied Sciences
Overzicht R-codes
Hoofdstuk 5
Verdelingsvrije methoden
Normale toets
verdelingsvrije toets
R-code
pearson correlatie
spearman correlatie
cor(x, method = “spearman”)
t-testen
wilcoxon
wilcox.test
one-way ANOVA
Kruskal-Wallis
kruskal.test
two-way ANOVA
geen
NA
Repeated measures
Friedman
friedman.test